Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SKAP2O75563 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKAP2O75563 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms