Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP17L12C9JPN9 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms