Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PATL2C9JE40 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms