Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ERVV-1B6SEH8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms