Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 HPGD-214ENST00000542498 2786 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ADPRH-201ENST00000357003 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PRKG2-201ENST00000264399 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 EPHB6-202ENST00000422643 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 OLFML2B-201ENST00000294794 3160 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 SEC24B-203ENST00000504968 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VGLL3A8MV65 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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