Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAD54BQ9Y620 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms