Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PADI4Q9UM07 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms