Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIMKLBQ9ULI2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms