Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALD1Q9ULE6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms