Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
BRPF3Q9ULD4 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
BRPF3Q9ULD4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms