Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB23Q9ULC3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms