Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FBXL4Q9UKA2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FBXL4Q9UKA2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms