Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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