Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP35Q9P2H5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP35Q9P2H5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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