Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SH3BP4Q9P0V3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms