Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ERVK-5Q9HDB9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVK-5Q9HDB9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms