Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOBEC3GQ9HC16 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms