Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms