Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BBS2Q9BXC9 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BBS2Q9BXC9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BBS2Q9BXC9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BBS2Q9BXC9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BBS2Q9BXC9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BBS2Q9BXC9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BBS2Q9BXC9 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BBS2Q9BXC9 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BBS2Q9BXC9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BBS2Q9BXC9 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BBS2Q9BXC9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BBS2Q9BXC9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BBS2Q9BXC9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BBS2Q9BXC9 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BBS2Q9BXC9 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BBS2Q9BXC9 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms