Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2Q9BX26 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms