Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms