Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms