Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms