Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
AGAP3Q96P47 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms