Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf72Q96LT7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms