Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNX27Q96L92 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms