Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRIQ1Q96JM4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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