Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BORCS6Q96GS4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BORCS6Q96GS4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms