Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
RNF185Q96GF1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms