Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSPRY1Q96DX4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms