Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms