Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM8

ACSF2, Acyl-CoA synthetase family member 2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSF2Q96CM8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSF2Q96CM8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms