Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF34Q969K3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms