Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CAVIN3Q969G5 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms