Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD6Q92537 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms