Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM35BQ8NCS4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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