Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ANKRD42Q8N9B4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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