Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLDN19Q8N6F1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 310.7 ms