Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HECW1Q76N89 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms