Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LACTB2Q53H82 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LACTB2Q53H82 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LACTB2Q53H82 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LACTB2Q53H82 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms