Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms