Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL38Q2WGJ6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL38Q2WGJ6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms