Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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RTL8BQ17RB0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
RTL8BQ17RB0 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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