Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PTPRNQ16849 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PTPRNQ16849 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PTPRNQ16849 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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PTPRNQ16849 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PTPRNQ16849 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PTPRNQ16849 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PTPRNQ16849 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PTPRNQ16849 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PTPRNQ16849 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PTPRNQ16849 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRNQ16849 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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