Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCL15Q16663 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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