Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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