Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC6Q16204 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC6Q16204 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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