Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms