Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ADCY1-201ENST00000297323 12503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 GCC2-201ENST00000309863 7537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 KIAA0556-201ENST00000261588 6616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ZZEF1-201ENST00000381638 11456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 STARD13-201ENST00000255486 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 STARD13-204ENST00000399365 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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VAMP3Q15836 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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VAMP3Q15836 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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VAMP3Q15836 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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VAMP3Q15836 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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VAMP3Q15836 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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VAMP3Q15836 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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VAMP3Q15836 SETD7-201ENST00000274031 7365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC10.87□□□□□ -0.67
VAMP3Q15836 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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