Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC85BQ15834 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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